小学6年级时的一天，进藤光去爷爷家里寻宝，不料偶然翻出一个旧棋盘。就在他接触棋盘的一瞬间，附身于棋盘之中的平安时代天才棋手——藤原佐为的灵魂进入了小光的体内。佐为热爱围棋如同生命，小光受到他的熏陶，又结识了棋坛名人之子——天才少年塔矢亮，渐渐对围棋产生了兴趣。
塔矢名人与Sai的网上对局进入中盘，两人棋逢对手展开了激烈的厮杀。Sai的一着妙手令形势逆转，最后名人以半目之差告负，了却了佐为的心愿。第二天，绪方九段向小光逼问Sai的身份，并提出要与Sai对局。在名人的帮助下，小光保守住了秘密，Sai也再次从网上消失了。一天，小光放学后偶遇仓田六段，为了测试自己的实力，小光提出和仓田对局。仓田虽然接受了挑战，但却提出双方均使用同一种颜色的棋子。然而，小光在一色棋的较量中与对手针锋相对，令仓田承认了自身的实务。塔矢名人突然宣布引退，整个围棋界都为之轰动，而小光却已经向更高的目标发起了挑战。但他没有觉察到佐为心中的不安……

第114局 sai vs toya koyo③
第115局 sai vs toya koyo④
第116局 等待千年的答案
第117局 发觉
第118局 追查
第119局 测试实力
第120局 一色棋
第121局 塔矢行洋引退！
番外篇 请客吧，和谷！