一、《云南史料丛书》收录史料四百余部。上起汉代、下迄清代，近二千年间。凡云南古代的历史、地理、政治、经济、军事、交通、民族、风土、物产等重要的中文文献资料，力求囊括其中。
二、每篇史料分三部分，前为方国瑜先生对该篇史料的考证，既《概说》；次为所收史料正文，再为整理者就史料的版本，价值等问题所写的《后记》。
三、所收的史料基本上按照方国瑜先生《云南史料目录概说》的时间顺序编排，分为汉晋、唐宋、元、明、清五个阶段，各个阶段再按史料体裁归类编排。
四、收入《丛刊》的史料，以校点的方式进行整理，对价值的前人所作的注、疏、证、解、索引等均保留原貌，仅改行小字注为单行小字注。
五、本书文字统一使用简体化，异体字据1999年版《辞海》径改规范字，不再改正校记，同时考虑到人名、地名、书名以及一些古籍文句，改用简化字或选用规范字后可能引起误解的，仍保留原来的繁体或异体。
六、由于《云南史料丛刊》份量巨大，内容丰富，目录繁多，不便翻检，将各卷目录按顺序汇总，单独成册，以方便读者检索。

编辑说明
《云南史料丛刊》（卷1）目录
史记·西南夷列传
附载：
节录《南越尉佗列专》
节录《大宛列传》
节录《货殖列传》
节录《平准书》
节录《司马相如列传》
喻巴蜀檄 难蜀父老书
喻巴蜀檄
难蜀父老书
汉书·西南夷列传
附载：
节录《汉书·本纪》
《武帝纪》
《昭帝纪》
《成帝纪》
节录《食货志》
节录《郊祀志》下
节录《天文志》
节录《五行志》
节录《卫青、霍去病列传》
节录《杜周列传》
节录《王褒列传》
节录《酷吏列传》
节录《王莽列传》
《汉书·地理志》西南诸郡 《续汉书·郡国志》西南诸郡
《汉书·地理志》西南诸郡摘录
附：《汉书·地理志》载郡国地名后通论摘录
《续汉书·郡国志》西南诸郡摘录
后汉书·西南夷列传
附载：
节录《后汉书》诸帝纪
光武帝纪
显宗孝明帝纪
肃宗孝章帝纪
孝和、孝殇帝纪
孝安帝纪
孝顺、孝冲、孝质帝纪
孝桓题帝纪
孝灵帝纪
节录《后汉书》诸列传
公孙述列传
岑彭列传
陈禅列传
种暠列传
杜乔列传
党锢列传
刘焉列传
循吏列传
儒林列传
节录《后汉书》诸志
天文志中
五行志四
百官志五
附载：
班固《东都赋》摘句
附载：
节录《东观汉记》
明帝纪
安帝纪、顺帝纪
王阜传
……
《云南史料丛刊》（卷2）目录
《云南史料丛刊》（卷3）目录
《云南史料丛刊》（卷4）目录
《云南史料丛刊》（卷5）目录
《云南史料丛刊》（卷6）目录
《云南史料丛刊》（卷7）目录
《云南史料丛刊》（卷8）目录
《云南史料丛刊》（卷9）目录
《云南史料丛刊》（卷10）目录
《云南史料丛刊》（卷11）目录
《云南史料丛刊》（卷12）目录
《云南史料丛刊》（卷13）目录